Канатбек Ахмедов родился 31 марта 1983 года в селе Кызыл-Жол Баткенской области. В 2005-м окончил Ошский гуманитарный институт по специальности "физическая культура", в 2010-м — судебно-прокурорский факультет Ошского государственного юридического института.