Государственный флаг был утвержден Верховным Советом КР 3 марта 1992 года, и уже 5 марта на здании Дома правительства в Бишкеке спустили знамя Киргизской ССР, впервые подняв вместо него флаг независимого Кыргызстана. Новый стяг водрузили при участии президента Аскара Акаева, премьер-министра Турсунбека Чынгышева и спикера парламента Медеткана Шеримкулова.
Ранее власти объявили конкурс эскизов флага и других государственных символов, была создана специальная комиссия, которая выбрала лучшие работы. В результате авторами флага стали несколько человек: Эдиль Айдарбеков, Бекбосун Жайчыбеков, Сабыр Иптаров, Жусуп Матаев и Маматбек Сыдыков.
Значение элементов флага:
тундук кыргызской юрты красного цвета символизирует единство, дружбу и отчизну;
40 расходящихся лучей золотистого цвета означают объединение сорока племен кыргызского народа под одним тундуком;
золотистый цвет символизирует богатство и стабильность;
красный цвет символизирует победу, героизм и храбрость.